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一种靶向SARS-COV-2刺突蛋白的框架核酸适配体及应用 

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申请/专利权人:中山大学附属第八医院(深圳福田)

摘要:本发明属于生物医药技术领域,具体涉及一种靶向SARS‑COV‑2刺突蛋白的框架核酸适配体及应用。本发明设计了针对新冠病毒表面刺突蛋白的RBD不同突变区域的三种特异性适配体Aptamer序列以及框架四面体tFNA的结构序列,利用碱基互补配对原则将所述特异性适配体序列连接在四面体核酸框架上,合成框架核酸适配体A‑tFNA纳米结构,所述框架核酸适配体有效实现了对新冠病毒SARS‑CoV‑2刺突蛋白的靶向捕获,从而阻止其与细胞表面的ACE2受体结合感染细胞,即可有效实现对新冠病毒SARS‑CoV‑2的抗感染效果,且抗感染时间更持久。

主权项:1.一种框架核酸适配体,其特征在于,所述框架核酸适配体包括框架序列、链接序列和适配体序列;所述适配体序列通过链接序列与框架序列连接,然后通过碱基互补配对原则组装形成四面体框架核酸适配体;所述框架序列包括四条DNA链,所述四条DNA链的核苷酸序列如1-3中至少一组所示:1ssDNAA13:5’-ACACTACGTCAGAACAGCTTGCATCACTGGTCACCAGAGTA-3’,ssDNAB13:5’-ACGAGCGAGTTGATGTGATGCAAGCTGAATGCGAGGGTCCT-3’,ssDNAC13:5’-TCAACTCGCTCGTAACTACACTGTGCAATACTCTGGTGACC-3’,ssDNAD13:5’-TCTGACGTAGTGTATGCACAGTGTAGTAAGGACCCTCGCAT-3’;2ssDNAA17:5’-ACATTCCTAAGTCTGAAACATTACAGCTTGCTACACGAGAAGAGCCGCCATAGTA-3’,ssDNAB17:5’-TATCACCAGGCAGTTGACAGTGTAGCAAGCTGTAATAGATGCGAGGGTCCAATAC-3’,ssDNAC17:5’-TCAACTGCCTGGTGATAAAACGACACTACGTGGGAATCTACTATGGCGGCTCTTC-3’,ssDNAD17:5’-TTCAGACTTAGGAATGTGCTTCCCACGTAGTGTCGTTTGTATTGGACCCTCGCAT-3’;3ssDNAA21:5’-ATTTATCACCCGCCATAGTAGACGTATCACCAGGCAGTTGAGACGAACATTCCTAAGTCTGAA-3’,ssDNAB21:5’-ACATGCGAGGGTCCAATACCGACGATTACAGCTTGCTACACGATTCAGACTTAGGAATGTTCG-3’,ssDNAC21:5’-ACTACTATGGCGGGTGATAAAACGTGTAGCAAGCTGTAATCGACGGGAAGAGCATGCCCATCC-3’,ssDNAD21:5’-ACGGTATTGGACCCTCGCATGACTCAACTGCCTGGTGATACGAGGATGGGCATGCTCTTCCCG-3’;所述适配体序列的核苷酸序列如S1-S3中至少一项所示:S15’-CAGCACCGACCTTGTGCTTTGGGAGTGCTGGTCCAAGGGCGTTAATGGACA-3’;S25’-ATCCAGAGTGACGCAGCATTTCATCGGGTCCAAAAGGGGCTGCTCGGGATTGCGGATATGGACACGT-3’;S35’-CGCAGCACCCAAGAACAAGGACTGCTTAGGATTGCGATAGGTTCGG-3’。

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