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基于同源搜索的微生物小蛋白注释方法 

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申请/专利权人:复旦大学

摘要:本发明公开了基于同源搜索的微生物小蛋白注释方法,属于微生物组以及宏基因组学技术领域,整合全球微生物组基因组及基因数据,利用同源比对对基因组或宏基因组中小蛋白的鉴定和注释。该注释方法,包括如下步骤:第一步、输入序列;第二步、同源比对;第三步、注释:结合所有的比对命中信息,基于已整理的全球微生物数组smORF注释数据,对得到的候选小蛋白序列进行物种分类、栖息地注释、功能结构域注释和质量控制信息匹配;第四步、输出。本发明基于自构建的全球微生物组smORF目录,利用同源比对方法对微生物基因组进行smORF预测和注释,降低预测的假阳性率,提高smORF预测的可信度。

主权项:1.基于同源搜索的微生物小蛋白注释方法,其特征在于,整合全球微生物组基因组及基因数据,利用同源比对对基因组或宏基因组中小蛋白的鉴定和注释。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 复旦大学 基于同源搜索的微生物小蛋白注释方法

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