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申请/专利权人:北京求臻医学检验实验室有限公司
摘要:本发明涉及医学分子生物学技术领域,特别涉及基于低深度WGS测序末端特征的癌症早期预测方法,通过采集健康人群与肿瘤人群样本,同时提取和统计样本cfDNA片段末端特征及break‑point末端特征,全面地考虑了不同长度和不同位置的片段末端特征,并利用优化的Mscore算法,更简便区分健康人组和癌症病人组,且在不同数据量的情况下仍能保持高稳定性。
主权项:1.基于低深度WGS测序末端特征的癌症早期预测方法,其特征在于包括以下步骤:S1.对样品进行基因靶向测序,获取原始fastq文件;S2.对原始fastq文件进行数据控制,筛除低质量数据;S3.将质控后的fastq文件比对参考基因组获得bam文件,对bam文件进行数据过滤,去除重复序列;S4.分别统计cfDNA片段末端特征、break-point末端特征的数量和比例;S5.计算用于区分癌症病人的Mscore值。
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权利要求:
百度查询: 北京求臻医学检验实验室有限公司 基于低深度WGS测序末端特征的癌症早期预测方法
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