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一种基于TP0136基因异质性用于区分梅毒螺旋体不同亚型的分子分型方法 

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申请/专利权人:柯吴坚

摘要:本发明公开了一种基于TP0136基因异质性用于区分梅毒螺旋体不同亚型的分子分型方法,涉及一种对梅毒螺旋体不同菌株的分子分型方法,所述方法利用梅毒螺旋体属TP0136蛋白异质性建立。本发明方法通过检测梅毒螺旋体不同菌株TP0136基因异质性,用于区分梅毒螺旋体不同亚型,弥补了梅毒分子分型检测方法的不足;具有检测结果确切、灵敏度高的特点,易于推广。

主权项:1.一种基于非诊断或治疗目的的TP0136基因异质性用于区分梅毒螺旋体不同亚型的分子分型方法,其特征在于,所述方法利用梅毒螺旋体属TP0136蛋白异质性建立,具体步骤为:步骤1梅毒螺旋体属菌株传代和菌株DNA提取;步骤2梅毒螺旋体属TP0136序列分析和引物设计;步骤3梅毒螺旋体属TP0136DNA扩增、测序和分型;所述的梅毒螺旋体属包括9株梅毒苍白密螺旋体和广东省内临床梅毒患者分离的23株梅毒苍白密螺旋体临床分离株;所述9株梅毒苍白密螺旋体包括NicholsHouston株、NicholsSeattle株、NicholsDallas株、DAl-1株、Bal73-1株、Seattle81-4株、Chicago株、MexicoA株、SS14株;步骤1中所述的梅毒螺旋体属菌株传代是在新西兰白兔睾丸内进行的;步骤1中所述的梅毒螺旋体属菌株DNA提取中采用的1×细胞裂解缓冲液中包含10mMTris,0.1MEDTA,0.5%SDS;步骤3中所述的梅毒螺旋体属TP0136DNA扩增时采用的引物序列如SEQIDNO:1-5所示;步骤3中所述的梅毒螺旋体属TP0136DNA扩增时采用的PCR扩增反应试剂为每50μLPCR扩增反应试剂含5μL待检测DNA样本、200μMdNTPs、5μL10×GoTaqPCR缓冲液、1.5mMMgCl2、0.6μMTP0136引物、0.5U热启动TaqPCR聚合酶;步骤3中所述的梅毒螺旋体属TP0136DNA扩增时的条件控制为95℃变性10min;95℃1min、60℃2min、72℃1min,共45个循环;最后72℃延伸10min;步骤3中所述的梅毒螺旋体属TP0136DNA测序是将PCR扩增的产物经1.5%琼脂糖凝胶电泳鉴定及纯化回收,双向DNA测序法进行测序。

全文数据:

权利要求:

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