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申请/专利权人：湖北工业大学
摘要：本发明公开了一种基于计算机辅助的天然Keap1‑Nrf2PPI抑制剂筛选方法，该方法基于天然产物数据库，通过聚类分析、类药性计算、分子对接、MD模拟和体外高通量实验等步骤逐步筛选潜在的天然Keap1‑Nrf2PPI抑制剂；相对于传统实验研究和常规CADD研究开发的Keap1‑Nrf2PPI抑制剂，本发明方法不仅可以从天然产物中获取类药性良好、结构类型多样、与Keap1作用模式合理的Keap1‑Nrf2PPI抑制剂，而且成本低廉、命中率高。本发明为发掘出更为安全和有效的Keap1‑Nrf2PPI抑制剂提供了一种新途径，有助于突破人工合成Keap1‑Nrf2PPI抑制剂的瓶颈。
主权项：1.一种基于计算机辅助的天然Keap1-Nrf2PPI抑制剂筛选方法，其特征在于，包括：（1）计算并筛选天然产物分子数据库中候选分子的指纹描述符，根据指纹描述符将候选分子划分为不同结构子集；（2）针对任一结构子集，去除不满足Lipinski五规则的候选分子，计算剩余候选分子的类药性并排序，同时将剩余候选分子与Keap1进行半柔性对接获取亲和力数据；根据类药性和亲和力对剩余候选分子进行筛选，并将所得候选分子与Keap1进行分子动力学模拟以获取结合能数据，其中结合能小于预设阈值的候选分子即为苗头化合物。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 湖北工业大学 基于计算机辅助的天然Keap1-Nrf2 PPI抑制剂筛选方法
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