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基于单链测序数据多癌症检测准确率的提升方法 

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申请/专利权人:华旭

摘要:本发明公开了一种基于单链测序数据的多癌症检测准确率提升方法,包括如下步骤:1:利用血液样本得到训练集,将血液样本进行单链DNA甲基化测序;2:利用训练集识别各类癌症特异的DNA差异甲基化位点DMR和DNA差异半甲基化位点DHMR;3:将训练集分为N等份,得到N组数据;4:利用N组数据采用深度神经网络DNN模型分别训练DMR模型和DHMR模型;5:将DMR子模型和DHMR子模型融合,进行二次校准,得到统一模型,利用所述统一模型对血液样本进行检测。本发明同时挖掘了DNA甲基化和DNA半甲基化两种特征,并提出DNA甲基化和半甲基化特征的整合模型,显著提升了癌症预测的精度,优于任意单个特征的预测模型。

主权项:1.一种基于单链测序数据的多癌症检测准确率提升方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1:利用血液样本得到训练集,训练集中包含多类癌症病人血液和正常人血液,将血液样本进行单链DNA甲基化测序;步骤2:利用训练集识别各类癌症特异的DNA差异甲基化位点DMR和DNA差异半甲基化位点DHMR;步骤3:将训练集分为N等份,得到N组数据,用于训练N个模型;步骤4:利用N组数据采用深度神经网络DNN模型分别训练DMR模型和DHMR模型,得到N个DMR模型和N个DHMR模型;步骤5:将N个DMR子模型和N个DHMR子模型融合,进行二次校准,得到统一模型,利用所述统一模型对血液样本进行检测。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 华旭 基于单链测序数据多癌症检测准确率的提升方法

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