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申请/专利权人：上海仁东医学检验所有限公司;苏州仁东生物工程有限公司
摘要：本发明公开了一种肌层浸润性膀胱癌多组学分子分型方法，该方法依据肌层浸润性膀胱癌患者的转录组基因丰度表达特征和蛋白质丰度表达特征对肌层浸润性膀胱癌进行聚类分析，得到与预后相关的肌层浸润性膀胱癌分子亚型。本发明还公开了肌层浸润性膀胱癌多组学分子亚型预测的方法及系统。本发明通过整合并筛选转录组和蛋白质组的丰度表达数据，并运用多组学一致性聚类方法，确定了肌层浸润性膀胱癌的多组学分子分型，并构建了分子亚型预测系统，从而有助于准确预测肌层浸润性膀胱癌的多组学分子亚型，提示患者预后，为精准医疗提供有效参考。
主权项：1.肌层浸润性膀胱癌多组学分子分型方法，所述方法非用于疾病的诊断和治疗目的，其特征在于，依据肌层浸润性膀胱癌患者的转录组基因丰度表达特征和蛋白质丰度表达特征对肌层浸润性膀胱癌进行多组学分子分型，包括以下步骤：1获取MIBC患者和正常对照组织的转录组基因丰度表达数据和蛋白质丰度表达数据；2分析肿瘤组织和癌旁组织在转录组基因丰度表达和蛋白质丰度表达上的差异，筛选出在转录组基因丰度表达和蛋白质丰度表达上具有相同显著变化趋势的基因作为MIBC特异性基因；3对所述MIBC特异性基因及其对应蛋白质的丰度表达特征进行整合并聚类分析，获得MIBC最佳分型结果；上述步骤2，先对转录组基因在肿瘤组织和癌旁组织的丰度表达做差异分析，筛选出差异基因，然后对差异基因对应的蛋白质在肿瘤组织和正常人膀胱组织的丰度表达进行差异分析，筛选出差异蛋白质，保留在转录组和蛋白质两个组学层面均显著高表达或显著低表达的基因作为MIBC特异性基因，并保留与所述MIBC特异性基因对应的蛋白质；所述MIBC特异性基因及对应的蛋白质如表1所示：表1MIBC特异性基因及对应蛋白质
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权利要求：
百度查询： 上海仁东医学检验所有限公司 苏州仁东生物工程有限公司 MIBC多组学分子分型方法及预测系统
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