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一种ncRNA基因突变的解读方法、存储介质及终端 

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申请/专利权人:香港大学深圳医院

摘要:本发明公开了一种ncRNA基因突变的解读方法、存储介质及终端,解读方法包括:构建ncRNA基因致病性突变标准数据集、ncRNA基因良性变异标准数据集和用于实验验证的ncRNA基因变异有害性标准数据集;利用前述数据集构建训练ncRNA基因变异有害性的计分模型、ncRNA基因相关疾病表型相似度计分模型,采用数据挖掘软件对包含相同数量的致病性和良性的ncRNA基因变异位点的有害性计分文件和ncRNA基因的疾病表型相似度计分文件进行逻辑回归建模,得到特异性评估ncRNA基因致病性突变的筛查鉴定的算法模型,对算法模型进行训练,利用训练后的算法模型对ncRNA基因突变进行解读和报告。实现针对ncRNA基因突变的标准化、自动会、智能化和高通量地临床解读报告,大大提升了解读效率,解读的准确性。

主权项:1.一种ncRNA基因突变的解读方法,其特征在于,包括:构建ncRNA基因致病性突变标准数据集、ncRNA基因良性变异标准数据集和用于实验验证的ncRNA基因变异有害性标准数据集;利用所述ncRNA基因致病性突变标准数据集和ncRNA基因良性变异标准数据集,对两个及以上有监督的机器学习算法分别进行模型训练,得到特异性评估ncRNA基因变异有害性的计分模型;采用所述特异性评估ncRNA基因变异有害性的计分模型对候选ncRNA基因的变异有害性进行计算,得到ncRNA基因的变异位点的有害性计分文件;构建ncRNA基因与人类疾病表型关联的标准数据集;基于该标准数据集构建ncRNA基因相关疾病表型相似度计分模型,采用所述ncRNA基因相关疾病表型相似度计分模型对所述候选ncRNA基因的疾病表型相似度进行计算,得到所述候选ncRNA基因的疾病表型相似度计分文件;采用数据挖掘软件对包含相同数量的致病性和良性的ncRNA基因变异位点的有害性计分文件和ncRNA基因的疾病表型相似度计分文件进行逻辑回归建模,得到特异性评估ncRNA基因致病性突变的筛查鉴定的算法模型;采用所述实验验证的ncRNA基因变异有害性标准数据集对所述算法模型进行性能优化评估,采用优化评估后的算法模型对ncRNA基因突变进行解读和报告。

全文数据:

权利要求:

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