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申请/专利权人：杭州洛兮医学检验实验室有限公司
摘要：本申请属生物医药领域，具体涉及一种检测肺炎支原体及其23SrRNA基因耐药位点突变的生信分析方法。本申请针对病原宏基因组高通量测序数据，采用生物信息学的分析方法，可以快速检测该样本是否感染了肺炎支原体以及23SrRNA基因2063、2064、2067以及2617四个位点的碱基突变情况。在肺炎支原体鉴定上，与传统的分离培养法相比，本申请提供的方法更加快速并且成本更低；在耐药突变检测上，也与传统的通过设计突变位点的特异性PCR引物的方法有所不同；此外，本申请还根据位点的碱基组成发明了一种突变分析方法，不再单纯依赖现成的变异检测软件；本申请提供的方法具有检测灵敏度高、特异性强、重复性好，所需时间短等优点，适用于肺炎支原体及其23SrRNA耐药位点的检测。
主权项：1.一种检测肺炎支原体及其23SrRNA基因耐药突变的生物信息分析方法，其特征在于，包括以下步骤：S-1.数据准备；S-2.宏基因组高通量测序数据质控；S-3.往人源序列数据库上进行比对，以去除人源序列；S-4.将步骤S-3获取到的序列往肺炎支原体参考基因组上进行比对；S-5.制定比对序列筛选条件并从步骤S-4的比对结果中提取满足条件的序列；S-6.将步骤S-5满足筛选条件的比对序列往23SrRNA基因上进行比对，获取输出文件；S-7.基于步骤S-6输出文件，进行耐药突变位点检测；S-8.制定筛选原则并对S-7中的变异结果进行筛选。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 杭州洛兮医学检验实验室有限公司 一种检测肺炎支原体及其23S rRNA基因耐药突变的生物信息分析方法
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