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申请/专利权人:中国科学院水生生物研究所
摘要:本申请涉及淡水经济鱼的SNP探针开发技术领域,具体涉及生成淡水经济鱼SNP探针的方法、装置、电子设备及介质,能够高效获得淡水经济鱼的SNP探针,对于淡水经济鱼的单性养殖及优良性状的快速选育具有重要意义。
主权项:1.生成淡水经济鱼SNP探针的方法,包括:获得第一Kmer,所述第一Kmer表征至少一个所述淡水经济鱼的参考基因组中的单拷贝区间;获得第二Kmer,所述第二Kmer表征至少一个所述淡水经济鱼的reads中高保真的、与所述参考基因组正向序列相同且无Indel的Kmer;从所述参考基因组中筛得SNP位点;获得第一Kmer对,所述第一Kmer对表征所述单拷贝区间中于同一坐标上的仅具有一个二态性SNP位点的、成对的第二Kmer;根据所述第一Kmer对于所述淡水经济鱼的reads的检出次数和检出数量,从所述第一Kmer对中筛选并输出第二Kmer对;根据所述第二Kmer对生成SNP探针。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 中国科学院水生生物研究所 生成淡水经济鱼SNP探针的方法、装置、电子设备及介质
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