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一种基于多组学生物标志物的OSA发病风险预测方法及装置 

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申请/专利权人:复旦大学

摘要:本发明公开了一种基于多组学生物标志物的OSA发病风险预测方法,包括以下步骤:获取健康组和OSA发病组的医学数据;分别对体脂成分和代谢组学数据进行预处理,以获得包含体脂特征和代谢特征的组学特征,并将组学特征与医学数据组成数据集;根据所述数据集对预构建的预测模型进行训练,以获得风险预测模型;将待预测用户的医学数据输入至风险预测模型中,以获得用户的OSA发病风险预测结果。本发明还提供了一种OSA发病风险预测装置。本发明提供的方法可以提高OSA发病风险预测的准确率,从而为医师的医疗诊断提供有效的指导。

主权项:1.一种基于多组学生物标志物的OSA发病风险预测方法,其特征在于,包括以下步骤:获取健康组和OSA发病组的医学数据,其包括个人信息,和对应的体脂成分以及代谢组学数据;分别对体脂成分和代谢组学数据进行预处理,以获得包含体脂特征和代谢特征的组学特征,并将所述组学特征与医学数据组成数据集,所述预处理包括数据标准化,ANOVA分析,相关性分析以及基于mRMR与Lasso回归特征筛选,其具体过程如下:对OSA组和健康组进行数据标准化,以获得对应的Z分数,并将Z分数超出mean±3SD的异常值剔除以去除离群数据;通过ANOVA分析获取OSA组和健康组之间的差异指标,并根据所述差异指标采用相关性分析去除相关系数大于0.9的指标,并通过mRMR算法筛选出10个最相关特征,将所述10个最相关特征通过lasso回归筛选出与体脂成分和代谢组学最佳特征集合;所述最佳特征集合包括体脂成分对应的android区域脂肪、内脏脂肪体积和四肢区域脂肪,以及代谢组学数据对应的高密度脂蛋白亚型,低密度脂蛋白亚型和极低密度脂蛋白亚型,所述四肢区域脂肪包括右臂全部脂肪、左腿全部脂肪以及躯干左侧区域脂肪,所述高密度脂蛋白亚型包括H0A2和H0PL,所述低密度脂蛋白亚型包括L2PN和L6TG,所述极低密度脂蛋白亚型包括V1TG和V5PL;根据Lasso回归分析以获得最佳集合特征集合中各特征的权重;将最佳特征集合与对应的权重组成组学特征;根据所述数据集对预构建的预测模型进行训练,以获得用于预测OSA发病风险的风险预测模型,所述风险预测模型的表达式如下:Nomoscore=β1*性别+β2*年龄+β3*BMI+β4*fat_predicted+β5*lipop_predicted其中,fat_predicted表示体脂特征,lipop_predicted表示代谢特征,β1,β2,β3,β4以及β5表示模型参数的权重参数;fat_predicted=-2.9492+android区域脂肪*0.3932+内脏脂肪体积*0.9142+右臂全部脂肪*0.1958-左腿全部脂肪*0.490+躯干左侧区域脂肪*0.3543;lipop_predicted=2.5396+H0A2*0.0299+H0PL*0.4082-L2PN*0.0823-L6TG*0.2537-V1TG*0.4146-V5PL*0.2580;将待预测用户的医学数据输入至所述风险预测模型中,以获得用户的OSA发病风险预测结果。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 复旦大学 一种基于多组学生物标志物的OSA发病风险预测方法及装置

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