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申请/专利权人:中国医学科学院血液病医院(中国医学科学院血液学研究所);天津协和博精医学诊断技术有限公司
摘要:本发明涉及一种SBDS基因二代测序数据分析方法、装置及设备。本发明设计全新的二代测序数据分析策略,通过bam文件分析SBDS与SBDSP1参考基因组上的测序reads匹配差异,进行reads的再调整分配,能够准确鉴别SBDS基因突变和SBDSP1基因突变,有效提高SBDS基因突变检测的准确度,提高时效性,此外,设计校正方法,进一步提高检测准确度,使分析SBDS基因突变更简便、快速。
主权项:1.一种SBDS基因二代测序数据分析方法,其特征在于,所述方法包括:取SBDS基因的二代测序数据,将测序数据的reads比对到参考基因组,获得bam文件;基于所述bam文件计算SBDS基因突变物理位置的Totalcounts和SBDSP1基因物理位置的Totalcounts;计算SBDS基因突变物理位置的Totalcounts和SBDSP1基因物理位置的Totalcounts的比值,若所述比值1.2,则判定SBDS基因突变不存在,若所述比值为0.8~1.2,则判定SBDS基因突变真实存在,若所述比值0.8;则判定SBDS基因突变真实存在并且突变频率需要进行校正。
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权利要求:
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