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一种筛选新冠病毒主蛋白酶小分子抑制剂的方法及筛选模型 

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申请/专利权人:中国医学科学院医药生物技术研究所

摘要:本发明涉及一种筛选新冠病毒主蛋白酶mainprotease,Mpro小分子抑制剂的方法及筛选模型。该方法及筛选模型基于荧光偏振fluorescencepolarization原理,以荧光探针FITC‑Substrate‑Biotin作为新冠病毒Mpro的水解底物,再以亲和素avidin终止其水解反应,以多功能酶标仪检测实验体系的毫偏值millipolarizationunits,mP。活性化合物在本筛选模型中表现较高的mP值,非活性化合物则表现较低的mP值。

主权项:1.一种用于筛选新冠病毒主蛋白酶(mainprotease,Mpro)小分子抑制剂的方法,所述的方法包括如下步骤:(1)以大肠杆菌原核表达方法制备高活性Mpro重组蛋白;(2)添加待筛选化合物与Mpro重组蛋白共同孵育;步骤(2)中,将浓度为100~2000nM的Mpro重组蛋白溶液与浓度为1~5mM的待筛选化合物按比例混合后,在室温下共同孵育20~60min;(3)以异硫氰酸荧光素(fluoresceinisothiocyanate,FITC)和Biotin标记的FITC-Substrate-Biotin多肽作为Mpro水解底物,在室温下共同孵育5~60min;所述Biotin标记的FITC-Substrate-Biotin多肽为FITC-AVLQSGFRKK-Biotin;步骤(3)中,FITC-Substrate-Biotin浓度为20~100nM,加入的FITC-Substrate-Biotin溶液的体积为步骤(2)的体系的12~11(vv);加入FITC-Substrate-Biotin后,室温孵育5~40min;(4)以亲和素终止水解反应,在室温下共同孵育1~30min,以多功能酶标仪检测mP值;步骤(4)中,亲和素浓度为10~500nM,加入的亲和素溶液的体积为步骤(2)的体系的16~11(vv);加入亲和素后,室温孵育1~10min,以多功能酶标仪检测mP值;(5)绘制目标化合物的抑制曲线,计算目标化合物对新冠病毒主蛋白酶的IC50值;所述的新冠病毒主蛋白酶的氨基酸序列如SEQIDNO.2所示。

全文数据:

权利要求:

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