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一种伪噪声序列伴随编码的DNA存储方法 

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申请/专利权人:天津大学

摘要:本发明公开了一种伪噪声序列伴随编码的DNA存储方法。该方法采用分组纠错码对信息序列进行编码生成码字序列,并与伪噪声序列伴随构建两层编码序列,然后将其映射为数据DNA序列;将数据DNA序列合成、组装为中等长度DNA作为存储介质;数据读出时,对中等长度DNA进行高效建库和三代测序,从而生成测序读段;将测序读段解映射得到受损伪噪声序列,将其与已知伪噪声序列比对,确定读段对齐位置并识别插入删节错误,然后修正码字序列并进行共识、译码。本发明具有低测序覆盖度下快速恢复数据的能力,其优势在于伪噪声序列伴随编码对插入删节错误具有高鲁棒性,而伪噪声序列比对避免了复杂的组装操作,从而降低了处理复杂度。

主权项:1.一种伪噪声序列伴随编码的DNA存储方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:1采用分组纠错码对用户拟存储的数据进行分组编码,生成码字比特序列,并生成与码字比特序列长度相同的二进制伪噪声序列,将纠错编码的码字序列与伪噪声序列分为两层逐个比特对应伴随,构建两层长度完全相同的编码序列,按照特定的比特对到碱基的映射规则将两层编码序列映射为数据DNA序列;2将数据DNA序列与载体序列连接,利用化学合成或酶法合成、组装为不同形式的DNA片段实体,作为存储介质,对DNA片段进行建库和三代测序,生成测序读段;3对将测序读段解映射为受损码字序列和受损伪噪声序列,根据受损伪噪声序列与已知伪噪声序列比对,确定读段对齐位置并识别其中的插入删节错误,根据插入删节错误位置修正受损码字序列,修正后的码字序列逐比特进行多数投票判决得到一致性序列,将其送入译码器进行译码,恢复原始数据。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 天津大学 一种伪噪声序列伴随编码的DNA存储方法

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