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申请/专利权人:绍兴金箓生物技术有限公司
摘要:本发明提供了一种检测HER2基因扩增新型FISH探针的制备方法及其应用,属于医学检测领域。所述的探针制备工艺属于oligo探针制备法,具体步骤如下:利用分子生物信息学技术对重复序列进行去除,并设计和化学合成长度一致的靶向目的片段的寡核苷酸片段,建立寡核苷酸库,然后扩增和用荧光标记寡核苷酸序列,最后得到用于检测HER2基因扩增的荧光原位杂交探针。本发明开发了步骤简单且低成本的寡核苷酸探针制备工艺,该工艺不受BAC技术的限制,且生产出来探针的长度均一,能够比较轻松地穿透细胞核膜,从而提高杂交效率。此外,该新型探针还具备特异性高、背景低且清晰等特点,适用于临床上乳腺癌的诊断。
主权项:1.一种用于检测HER2基因扩增的新型FISH探针的制备方法,其特征在于,所述制备方法属于oligo探针制备法,包含以下步骤:1确定HER2基因和CEN17位点的探针靶点区域且去除探针靶点区域内的重复核苷酸序列,所述HER2基因探针靶点区域包含HER2基因的编码区以及5’端和3’端的非编码区域;2根据HER2基因CEN17位点探针靶点区域设计并化学合成长度一致的寡核苷酸片段,所述寡核苷酸序列长度为60~240bp;所述寡核苷酸片段包含接头和特异性结合HER2基因CEN17位点探针靶点区域的片段;所述寡核苷酸序列构成寡核苷酸库;3以步骤2中的寡核苷酸库为模板,以步骤2的接头序列为引物进行PCR扩增,得到探针模板库;以探针模板库为模板,使用含有荧光标记的正向、反向引物进行PCR扩增获得以CEN17为内对照,检测HER2基因扩增的原位杂交荧光探针,所述正向、反向引物序列同接头序列。
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百度查询: 绍兴金箓生物技术有限公司 一种检测HER2基因扩增新型FISH探针的制备方法及其应用
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