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一种基于双重Pull down的DNA亲和纯化测序建库方法 

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申请/专利权人:蓝景科信河北生物科技有限公司

摘要:本申请公开了一种基于双重Pulldown的DNA亲和纯化测序建库方法,属于基因测序技术领域。本申请提供的方法是在生物体外,两种不同的蛋白相互结合之后,进一步与DNA结合,获得与两种蛋白复合体结合的DNA,再进行高通量测序。该方法与ChIP‑seq相比,可以解决抗体限制,重复性成功率低,需用到有毒试剂的问题;与普通DAP‑seq相比,可以对形成异源二聚体的转录因子进行结合位点检测,还能够检测两种转录因子之间的互作。

主权项:1.一种基于双重Pulldown的DNA亲和纯化测序建库方法,其特征在于,包括如下步骤:1提取目标样本的基因组DNA;2对所述基因组DNA进行DNA片段化,得到DNA片段;3将所述DNA片段进行文库构建,得到DNA文库;4获取带有不同标签的两种转录因子表达载体;5将等量的两种转录因子表达载体置于同一体外蛋白表达体系中,进行体外蛋白表达,得到表达产物;6使用不同标签蛋白纯化磁珠依次对所述表达产物进行纯化,得到纯化产物;7将所述纯化产物与步骤3中的DNA文库结合,依次进行孵育、洗脱,得到洗脱后的DNA文库;8将所述洗脱后的DNA文库进行PCR扩增,得到测序文库;9对所述测序文库进行测序、分析,即可。

全文数据:

权利要求:

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