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用于病毒检测的基于CRISPR效应系统的诊断 

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申请/专利权人:博德研究所;麻省理工学院;哈佛学院院长等

摘要:本文提供了一种核酸检测系统,所述核酸检测系统包括:CRISPR系统,所述CRISPR系统包含效应蛋白和一种或多种被设计成结合至相应靶分子的向导RNA;基于RNA的掩蔽构建体;以及任选地,用以扩增样品中的靶RNA分子的核酸扩增试剂。在另一个方面,实施方案提供了一种多肽检测系统,所述多肽检测系统包括:CRISPR系统,所述CRISPR系统包含效应蛋白和一种或多种被设计成结合触发RNA的向导RNA;基于RNA的掩蔽构建体;以及一种或多种检测适体,所述一种或多种检测适体包含掩蔽的RNA聚合酶启动子结合位点或掩蔽的引物结合位点。在一些实施方案中,所述系统可以用于检测样品中的病毒。

主权项:1.一种核酸检测系统,所述核酸检测系统包括:CRISPR系统,所述CRISPR系统包含CRISPRVI型RNA靶向效应蛋白,其是C2c2效应蛋白或Cas13b效应蛋白,其中所述C2c2效应蛋白来自以下生物体:沙氏纤毛菌或韦德纤毛菌;一种或多种被设计成杂交至RNA靶分子的核糖核苷酸序列或DNA靶分子的互补核糖核苷酸序列的向导RNA;以及基于RNA的掩蔽构建体,其包含可检测配体和掩蔽组分所附接的RNA寡核苷酸,其中所述靶分子包括一种或多种病毒靶分子,用于扩增靶核酸分子的试剂,其是基于核酸序列的扩增NASBA试剂或重组酶聚合酶扩增RPA试剂;和粗样品,其中所述一种或多种病毒靶分子未从所述粗样品提取和或分离,任选地,其中所述粗样品包含灭活的核酸酶和或灭活的病毒,任选地其中所述粗样品包含核酸酶和或病毒灭活试剂,其中CRISPRVI型RNA靶向效应蛋白和杂交至RNA靶分子的核糖核苷酸序列或DNA靶分子的互补核糖核苷酸序列的向导RNA之间的复合物形成触发效应蛋白的非序列特异性的附带裂解活性,所述附带裂解活性裂解基于RNA的掩蔽构建体的非靶核糖核苷酸序列以产生或掩蔽可检测的信号。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 博德研究所 麻省理工学院 哈佛学院院长等 用于病毒检测的基于CRISPR效应系统的诊断

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