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申请/专利权人：恺佧生物科技(上海)有限公司
摘要：本发明提供了一种用于遏制体外转录反应中副产物形成的阻遏模块及其应用。具体地，本发明的阻遏模块带有发夹结构设计以及发夹结构两侧的碱基设计，且发夹结构两侧的碱基序列无法互补配对。所述阻遏模块被连接于线性双链DNA模板的下游，即阻遏模块位于双链DNA非模板链的3’端和DNA模板链的5’端。DNA非模板链的3’端含有阻遏模块，可遏制反义RNA和dsRNA的形成；DNA模板链的5’端含有阻遏模块，促进转录泡的解离，产生类似转录终止的效果，阻遏mRNA3’延伸副产物的产生。此外，IVT反应转录形成的mRNA的3’端也含有阻遏模块，能够遏制mRNA3’延伸副产物的形成。
主权项：1.一种用于遏制体外转录反应中副产物形成的阻遏模块，其特征在于，所述阻遏模块位于体外转录反应体系中的双链DNA模板下游，其中，所述阻遏模块具有式Ia所示结构： 式Ia中，“5’Z1-Z2-Z3-Z4-Z53’”所在的DNA单链为非模板链有义链；“3’Z1’-Z2’-Z3’-Z4’-Z5’5’”所在的DNA单链为模板链反义链；并且，在体外转录过程中，式Ia中的“5’Z1-Z2-Z3-Z4-Z53’”形成从5’端至3’端的式Ib所示结构： 式Ib中，“Z2-Z3-Z4”形成一发夹结构，其中Z2和Z4为碱基互补配对的发夹颈stem，Z3为发夹环loop；Z1和Z5分别为发夹结构两端的碱基序列，且Z1和Z5的碱基序列之间无法互补配对；以及，式Ia中的“3’Z1’-Z2’-Z3’-Z4’-Z5’5’”形成从3’端至5’端的式Ib’所示结构： 式Ib’中，“Z2’-Z3’-Z4’”形成一发夹结构，其中Z2’和Z4’为碱基互补配对的发夹颈stem，Z3’为发夹环loop；Z1’和Z5’分别为发夹结构两端的碱基序列，且Z1’和Z5’的碱基序列之间无法互补配对；在式Ia，式Ib和式Ib’中，“～”各自独立地表示碱基互补配对形成的氢键；“-”各自独立地表示化学键；并且，所述发夹结构中发夹颈，即Z2Z2’或Z4Z4’的长度为3-10nt；发夹环，即Z3Z3’的长度为3-10nt。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 恺佧生物科技(上海)有限公司 IVT反应副产物的形成机理及阻遏模块的设计应用
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